Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms