Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Podnl1Q6P3Y9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms