Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc3bQ6NWW9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms