Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms