Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms