Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmcc1Q69ZZ6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms