Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Pdzrn3Q69ZS0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Pdzrn3Q69ZS0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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Pdzrn3Q69ZS0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Pdzrn3Q69ZS0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Pdzrn3Q69ZS0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Pdzrn3Q69ZS0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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