Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sbno1Q689Z5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Sbno1Q689Z5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sbno1Q689Z5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sbno1Q689Z5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sbno1Q689Z5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sbno1Q689Z5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sbno1Q689Z5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Sbno1Q689Z5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sbno1Q689Z5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sbno1Q689Z5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sbno1Q689Z5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Sbno1Q689Z5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sbno1Q689Z5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sbno1Q689Z5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sbno1Q689Z5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Sbno1Q689Z5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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