Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sf1Q64213 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sf1Q64213 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sf1Q64213 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sf1Q64213 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms