Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms