Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sp4Q62445 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp4Q62445 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms