Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SypQ62277 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SypQ62277 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SypQ62277 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SypQ62277 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SypQ62277 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SypQ62277 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SypQ62277 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SypQ62277 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SypQ62277 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SypQ62277 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SypQ62277 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SypQ62277 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SypQ62277 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SypQ62277 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SypQ62277 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SypQ62277 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SypQ62277 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SypQ62277 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SypQ62277 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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SypQ62277 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SypQ62277 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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SypQ62277 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SypQ62277 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SypQ62277 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SypQ62277 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SypQ62277 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SypQ62277 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SypQ62277 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SypQ62277 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SypQ62277 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SypQ62277 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SypQ62277 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SypQ62277 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SypQ62277 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SypQ62277 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SypQ62277 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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SypQ62277 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SypQ62277 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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