Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sall3Q62255 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sall3Q62255 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms