Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sin3bQ62141 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms