Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms