Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbbp7Q60973 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp7Q60973 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms