Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Clec4a4Q5YIR8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Clec4a4Q5YIR8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Clec4a4Q5YIR8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Clec4a4Q5YIR8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clec4a4Q5YIR8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec4a4Q5YIR8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec4a4Q5YIR8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec4a4Q5YIR8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec4a4Q5YIR8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms