Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tdrd5Q5VCS6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms