Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms