Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme4Q5SSW2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms