Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

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Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp28Q5I043 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp28Q5I043 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp28Q5I043 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp28Q5I043 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp28Q5I043 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp28Q5I043 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp28Q5I043 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp28Q5I043 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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