Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Urb1Q571H0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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