Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn2bQ56A07 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn2bQ56A07 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn2bQ56A07 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn2bQ56A07 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn2bQ56A07 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn2bQ56A07 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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