Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox3aQ4TU90 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms