Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933416C03RikQ3V063 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms