Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm5aQ3UXZ9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms