Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW5

Foxred2, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxred2Q3USW5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxred2Q3USW5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms