Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS3

Drc1, Dynein regulatory complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Drc1Q3USS3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Drc1Q3USS3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Drc1Q3USS3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Drc1Q3USS3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Drc1Q3USS3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Drc1Q3USS3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Drc1Q3USS3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Drc1Q3USS3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Drc1Q3USS3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms