Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arhgef40Q3UPH7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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