Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms