Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp30Q3UN04 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Usp30Q3UN04 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Usp30Q3UN04 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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