Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrch2Q3UMG5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrch2Q3UMG5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms