Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms