Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mccc2Q3ULD5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mccc2Q3ULD5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms