Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms