Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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Gtpbp6Q3U6U5 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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