Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gse1Q3U3C9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gse1Q3U3C9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms