Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Palb2Q3U0P1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms