Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms