Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf3c3Q3TMP1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms