Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stt3bQ3TDQ1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms