Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hddc2Q3SXD3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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