Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Shroom4Q1W617 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shroom4Q1W617 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms