Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata18Q0P557 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms