Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MitfQ08874 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms