Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms