Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bp2Q06649 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms