Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd1Q04519 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms