Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Runx1Q03347 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms