Protein–RNA interactions for Protein: Q03288

Asip, Agouti-signaling protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AsipQ03288 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
AsipQ03288 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
AsipQ03288 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
AsipQ03288 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AsipQ03288 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms